野生與人工飼養(yǎng)的熱帶斑海豚有著不同的胃腸道微生物群
文章來源:張培君 | 發(fā)布時(shí)間:2024-09-20 | 【打印】 【關(guān)閉】
中國科學(xué)院深海科學(xué)與工程研究所柏仕杰副研究員為第一作者,張培君研究員和李松海研究員作為通訊作者發(fā)表在期刊Water Biology and Security上題為“Similarities and differences in gastrointestinal microbiomes between wild and human-cared spotted dolphins (Stenella attenuata) in natural waters”的一項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了生活在相似的環(huán)境中的熱帶斑海豚,食物來源差異是影響其腸道微生物群落組成的重要因素。
腸道微生物在食物消化中起著至關(guān)重要的作用,是宿主的第二免疫系統(tǒng)。盡管人們逐漸意識(shí)到它們的重要性,但由于采樣困難,科研人員對(duì)海洋哺乳動(dòng)物腸道微生物群落的了解仍然非常有限。
動(dòng)物自身系統(tǒng)發(fā)育地位、生長環(huán)境和飲食等是影響腸道微生物組成的主要因素。然而,這三個(gè)因素間的從屬地位目前尚不明確。本研團(tuán)隊(duì)先前的一項(xiàng)研究表明處于相似的飲食和水生環(huán)境中的海洋哺乳動(dòng)物,科及以上分類地位的枝系間腸道微生物組存在顯著差異。在此基礎(chǔ)上,本次研究在環(huán)境因素上控制同一地理種群的熱帶斑海豚,著重調(diào)查了食物變化對(duì)其腸道微生物組的影響——野外海豚自然捕食,而人工飼養(yǎng)的海豚飼喂有限種類的食物魚。
該研究使用 16S rRNA 基因的V4區(qū)對(duì)腸道微生物進(jìn)行分類,發(fā)現(xiàn)野生和人工飼養(yǎng)的海豚在整體以及特定部位的胃腸道微生物群落在結(jié)構(gòu)上存在著顯著差異。有趣的是,它們胃腸道中的微生物多樣性沒有太大差異,這表明差異主要源于微生物群落組成的變化。
研究人員在野生海豚組(五個(gè)指示性ASVs)和人工飼養(yǎng)海豚組(三個(gè)指示性ASVs)中都發(fā)現(xiàn)了指示性微生物。此外,還發(fā)現(xiàn)了大量潛在的致病菌,這突顯了未來對(duì)海洋哺乳動(dòng)物腸道微生物學(xué)進(jìn)行全面研究的必要性。
本文的研究結(jié)果不僅增強(qiáng)了科研人員對(duì)熱帶斑海豚腸道微生物學(xué)的理解,還清楚地闡述了同一海洋哺乳動(dòng)物物種內(nèi)胃腸道微生物群的相似性和差異,特別是當(dāng)食物來源的變化在其生態(tài)生活中發(fā)揮重要作用時(shí)。
野生(左)和人工飼養(yǎng)(右)的熱帶斑海豚后腸微生物群落組成在門(a)、科(b)和屬(c)三個(gè)分類水平的對(duì)照
本文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.watbs.2024.100288
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